趣闻收集 202304
2023-04-28老夫写程序就是一个词：敏捷
我只要你的真心，和阳精
文献翻译阅读应用推荐
在线翻译服务PDF文件翻译Free Online Translator网址:
https://www.onlinedoctranslator.com/zh-CN/translationform
无需登录, 保留原格式的PDF文件翻译器，如验证码无法通过大概率是机场质量差，无解决方法。
使用方法:
将文件拖入上传区，选择语言后点击转换，完成后自动下载。
Free Online Translator - Preserves your document’s layout (PDF, Word, Excel, PowerPoint, OpenOffice, text)
AI技术ChatPDFhttps://www.chatpdf.com
本地翻译软件小绿鲸英文文献阅读器——专注提高SCI阅读效率
一键翻译PDF文献，保留原文格式
支持下载Word版
知云自带含注释功能的PDF阅读器！多翻译引禁切换，支持中英互译！特有学术引華优化，翻译质量好！选中段落、句子、单词立即翻泽！支持输入或粘贴文宇进入翻译！免费使用，使用门槛低！
知云文献翻译官网-官方指定最新知云文献翻译及Xtranslato ...
公众号历史消息查询
引言效果展示过程使用以下网址进入历史消息:
https://mp.weixin.qq.com/mp/profile_ext?action=home&__biz={自己百度搜怎么获取公众号好biz值}==#wechat_redirect
示例:
https://mp.weixin.qq.com/mp/profile_ext?action=home&__biz=MzIyOTM2OTE2Ng====#wechat_redirect
获取公众号biz值:
结论引用
公众号新版不能跳转到历史消息啦？ | 微信开放社区
如何获取微信公众号标识（biz值）-小宇博客
利用Ubuntu主机搭建共享打印服务
引言实验室的打印机自带的无线打印功能不太好用, 基本上大家都处于一种时断时续的薛定谔状态, 惠普smart一次又一次的用行动证明了这玩意实在不是很smart, 所以用 linux 搭建一个共享打印机服务或许是个不错的选择.
这个方法需要:
一台不关机的linux设备(路由器, 主机都行)
设备有线直连打印机(或拥有稳定的打印机访问)
设备连接局域网并具有稳定ip地址
效果展示
过程Ubuntu安装CUPS服务本文以 Ubuntu 22.04 为例, 已使用 HP smart 安装打印机驱动并有线连接打印机.
123456789101112## 安装apt install cups aptitudeaptitude install ghostscriptaptitude install foomatic## 启用sudo systemctl start cupssudo systemctl enable cups## sudo nano /etc/cups/cupsd.conf## 修改配置vim /etc/cups/cupsd.conf
在 vim 中用 / 搜索关键词并更改配置 ...
docker 安装
引言效果展示过程docker pull 配置代理[1]12sudo mkdir -p /etc/systemd/system/docker.service.dsudo touch /etc/systemd/system/docker.service.d/proxy.conf
1234[Service]Environment="HTTP_PROXY=http://proxy.example.com:8080/"Environment="HTTPS_PROXY=http://proxy.example.com:8080/"Environment="NO_PROXY=localhost,127.0.0.1,.example.com"
docker 重装ubuntu1234567891011121314docker stop $(docker ps -a -q)docker rm $(docker ps -a -q)sudo apt-get remove docker docker-engine docker.io docker- ...
服务器 rstudio-server 问题修复记录
引言R 版本更新过程12345sudo rstudio-server verify-installation #查看安装是否正常sudo rstudio-server start #启动RStudio-serversudo rstudio-server status #查看RStudio-serversudo rstudio-server stop #关闭RStudio-serversudo rstudio-server restart #重启RStudio-server
失败记录修改 rserver.conf123456sudo vim /etc/rstudio/rserver.conf# rsession-which-r=/home/tenney/miniconda3/envs/R4.2/bin/Rsudo rstudio-server restartsudo rstudio-server status
修改123456vim rsession.conf# rsessio ...
差异分析分组构建到底谁在前面--关于limma包中model.matrix()的问题
引言在使用limma包进行差异分析的过程中，我们都知道至少需要表达矩阵和分组矩阵两个文件，而在一些例子当中，还出现了一种叫差异比较矩阵的东西，那为什么有些需要有些不需要呢？不需要的会不会得到完全相反的上调下调基因？
其实差异比较矩阵的差距只在于一行代码，是 design <- model.matrix(~Group) 还是 design <- model.matrix(~ 0 + Group) ，那么这个0究竟代表什么含义呢？
过程根据官方文档 9.2 , 这一段讨论了一个简单的单通道实验，比较了两组老鼠，一组是野生型（Wt），另一组是突变型（Mu）。该实验的目标是识别两组老鼠之间的差异表达基因。为此，提供了两种不同的设计矩阵构建方法。
首先是示例输入矩阵:
FileName
Target
File1
WT
File2
WT
File3
Mu
File4
Mu
File5
Mu
可以用R语言进行创建:
123456789101112## 创建文件名和目标向量filename <- c("File1", "F ...
如何使用TCGAbiolinks下载TCGA数据并整理
引言一般来讲，我们想要使用TCGA数据，大概有三种方法，一是直接从GDC官网或官方下载工具gdc-client下载文件后自行处理，二是使用数据库如UCSC Xena或Firehouse，三是使用TCGAbiolinks R包自动下载并处理。
从官网下载并不麻烦，但是第一是需要选取非常多的自定义选项，第二是网络环境不好会容易中断，对于初学者倒是一个非常好的了解生物信息学的途径，但遇到批量化处理需求的时候就会难以进行。其后是数据库法，数据库虽然方便，但是并不会随着官网的更新变动，如 GDC Xena Hub 最后一次更新时间是 2019-08-28 ， Firehose 更是停留在了更遥远的 2016_01_28 ……
那么, 如果我需要批量下载的话, 难道我需要一个个的从网页加入Cart获取mata吗, 我不要……
幸好，已经有人造了非常好用的轮子，当然可以轻松学习一下用起来啦。
TCGAbiolinks 包是从TCGA数据库官网接口下载数据的R包。它的一些函数能够轻松地帮我们下载数据和整理数据格式。其实就是broad研究所的firehose命令行工具的R包装！
需要注意的是，2022年 ...
如何用 Markdown 写毕业论文
引言上一回说道，Markdown 可以使用一些高级用法进一步提升文档的质量和可读性，以完成高要求的复杂文本写作如论文等。
那么，为什么我们需要用 Markdown 来写论文呢？
先总结一下毕业论文的特点：
文本量大，需要几十页甚至几百页
格式要求完全统一，每种段落都有自己的特有格式
图表均需要带有序号，并随章节次序动态调整
参考文献角标编号随顺序调整
…
那么，Word 可以为我们带来哪些呢？
所见即所得
样式模板设置各级标题及正文
自动生成目录
结合文献管理器自动生成参考文献列表及角标
页面设置及输出 PDF
…
看起来还不错，但是相应存在的问题是「易分心」和「易崩溃」。分段式的写作调整格式将会成为噩梦，一切超出输入时预想的格式修改，都将消耗掉成倍的时间与精力。一旦输入时没有规范好，写完之后掉过头来修改都会让难度指数式上升。而输入和排版同时进行加大了文件的复杂度，在保存耗时增加的同时使程序易于崩溃，而且在崩溃之后往往无法修复，版本控制也因此变得一团糟。
最令人烦躁的是，当你用 Word 和别人协作的时候，Word 本身就足以成为灾难。以参考文献引用为例，如果你不把 Mende ...
为什么我要用 markdown 写 word
引言当需要写长文档或者学术论文时，很多人会选择使用 Microsoft Word 这类传统的文字处理软件，但是使用 Markdown 写作后再将其转换成 Word 格式也是一种很不错的选择。
Word 的优势在于表现形式丰富多样，也就是”富文本编辑”，但相对的带来了文档之间格式不统一，复制容易出错，字体、大小、颜色均容易出现各种各样的问题，当进行长文档写作就很容易出现写作十分钟，格式半小时的窘境。而 Markdown 恰恰相反，所有的格式将由内容和模板提供。作为内容和文本解离的成果，你可以尽情关注于写作本身。
需要提醒的是，Markdown 并不适合所有人，AllinOne 式的工具观是不必要的，合适的场合用合适的工具是最高效且实用的。对于团队协作和同步写作来讲，十几 K 的 md 文档自然比几 M 的 Word 好上几个等量级，对于办公室办公来讲，天然 A4 纸的 Word 自然就比 md 适合打印。工具本身没有高下，但使用的场景决定了工具的价值。
所以，十分钟就可以学会的 Markdown 教程，试一下？
效果展示
正文1. Markdown 的优势和 Word 的不便Markdo ...