使用 WineZGUI 在 linux 上安装 exe
引言效果展示过程12345678910sudo dpkg --add-architecture i386sudo apt install zenity wine winetricks libimage-exiftool-perl icoutils gnome-terminal# 安装 flatpaksudo apt install flatpaksudo apt install gnome-software-plugin-flatpakflatpak remote-add --if-not-exists flathub https://dl.flathub.org/repo/flathub.flatpakrepo# 安装 WineZGUIsudo -E flatpak install flathub io.github.fastrizwaan.WineZGUI
结论引用
WineZGUI
在 Linux 上使用 WineZGUI 运行 Windows 应用和游戏 | Linux 中国
缺少部分基因长度 counts 还可以转换为 tpm 吗？
引言在转录组学的机器学习任务中，counts 值（即原始读取数）通常不适合作为输入数据，而每百万缩放因子长度（TPM, Transcripts Per Million）更适合作为特征。
而我们在实际使用的时候，很多 geo 的数据并不会提供 tpm 数据或原始 fastq 数据，因此，弄清楚 geo 数据集的 counts 转换为 tpm 的方法是有必要的。
事实上，互联网上有很多人提供了 counts 转换为 tpm 的教程[1-3], 一般的流程是：
通过 GTF 文件或基因长度文件获取外显子长度文件
构建带有对应基因长度的表达矩阵
计算 TPM
目标基因的外显子长度之和除以 1000
基于 counts 计算每千碱基 reads 长度标准化 (RPK, Reads Per Kilobase)
基于 RPK 计算 TPM
但是按照这个流程会出现一个问题，那就是计算 RPK 的过程中需要使用 Ensembl ID, 而 TPM 的过程中需要计算一次单样本所有表达量之和，所以如果按照这个流程就会造成两种可能：
无法计算 (无法 ID 转换或无法获得基因长度)
数据失真 (只计 ...
GOT-OCR2.0
引言看起来不错的 OCR 服务
效果展示过程12345678910111213## Clone this repository and navigate to the GOT foldergit clone https://github.com/Ucas-HaoranWei/GOT-OCR2.0.git# cd 'the GOT folder'cd GOT-OCR2.0/GOT-OCR-2.0-master/## Install Packageconda create -n got python=3.10 -yconda activate gotpip install -e .## Install Flash-Attentionpip install ninjapip install flash-attn --no-build-isolation
1234## test demo# python3 GOT/demo/run_ocr_2.0.py --model-name /GOT_weights/ --image-file /an/image/file.p ...
深夜忆刘慈欣短篇作品有感
深夜谈到刘浩存和她的九部影片，其中有一部带上她的眼睛，就忽然想到了刘慈欣的许多短篇作品，其中带上她的眼睛算是挺好看的作品了。
我记得还和其他几个短篇共享世界观，应该是全频带阻塞干扰，这个也要电影化了，讲的是俄罗斯和美国打仗，俄罗斯电子战技术全面被碾压，信号被窃听，系统被利用，然后主角冲进太阳制造了一场黑子爆发彻底阻断了地球信号三天……
其他很有趣的包括，地球大炮，讲的是人类打通地心做了一个超长电磁炮将上太空的成本降低到差不多为 0，但是因为没有经济收益而把发明者和创建者全干死了的故事（）
地球大炮里面好像就讲了带上她的眼睛里那艘在地心挂掉的船的一点信息
刘慈欣最好的短篇当属球状闪电，堪称三体前传，然后是朝闻道，讲的地球科学家面对地外超文明，在无知活下去和得到宇宙答案然后死中毫不犹豫的去死了的故事
可惜我研究女权后发现三体着实有点厌女，所以书虽然能看但是不太乐意推了，同理还有诗云，初看非常惊艳，讲的外星人因仰慕李白烧完了一个太阳系的资源写出了所有汉字可以写出的诗，却发现没有检索手段所以还是没有发现超越李白的诗噗，这篇点子很给力但充满了理工男的自大，实现过程还不如去看走进修仙 - 毓族失所 ...
RNA-seq 分析流程和代码
引言效果展示过程RNA-seq 分析流程和原理解析[1,2]
RNA-seq 分析代码[3]
结论引用
RNA-seq 分析流程 —— 概述 - 知乎
RNA-seq 分析：从软件安装到富集分析详细过程 - 简书
如何完成 RNA-seq 的分析流程？ - 知乎
人生的价值
人是为了向往而活的，是为了追逐感动而活的，为了睹见美而活的。
Dify 的介绍和部署
引言八月份的我：我已经忘了四月份的我为啥要建这个文件了，可能是为了 AI Agent？总之，现在我要建的时候正好发现这文件已经存在了，所以就用起来好了。
Dify 是一款开源的大语言模型 (LLM) 应用开发平台。它融合了后端即服务（Backend as Service）和 LLMOps 的理念，使开发者可以快速搭建生产级的生成式 AI 应用。即使你是非技术人员，也能参与到 AI 应用的定义和数据运营过程中。[1-2]
我需要的功能是”直观的 Prompt 编排界面、高质量的 RAG 引擎、稳健的 Agent 框架、灵活的流程编排”, 现在开始。
效果展示过程123456789101112# git config --global http.proxy <protocol>://<host>:<port>## git clonegit clone https://github.com/langgenius/dify.git## runcd dify/dockercp .env.example .envdocker-compose up -d## ch ...
如梦处醒然时间已去不复返
年少时，我总觉得生活是一场梦，我是一个梦中的人物。
我的举动会影响我的世界，但又有什么是重要的。
古圣是存在的吗，未来是存在的吗，我生存的意义是…存在的吗…?
小学初中的日子倒是无忧无虑，只管草长莺飞莺歌浪漫，但自高中起我就有一些对生命的疑惑。生命的好与坏是谁规定的，生命的价值是谁规定的，我真的要按照社会的规划去走完一生吗？生活中到底有没有转生，有没有重来，有没有穿越，有没有我们所期待的那些浪漫的事情或可以弥补遗憾的事情。
高中的我或许只是为了逃避或许只是顺着肉体的信号，选择了一条可以说是放纵的路，我逃课，我疯狂看番，我整日沉溺在娱乐当中，也因此并没有取得出色的成绩，但其实我不算很后悔，因为那无疑是”我”的一部分。
但不知道为什么，我一直有一种幻想，仿佛我在什么时候可以回来，可以重新在这个懵懂无知的时刻再活一次，可以用更超然的更正确的姿态去做人生中重要的选择。
也同样是不知道为什么，我今天忽然有了实感，有了”啊，我真的已经回不去了”的感觉，是因为年龄到了吗，是因为我重要发现随着时间的无情向前，我熟悉的事物都在老去，我幻想中的那些都不会发生，我所依赖所信赖的也会变化，吗？
我切实发现了我 ...
R 出现不兼容的时候使用 canda 运行
引言R 这个混乱的包管理系统经常会出现一下包冲突或者版本冲突所导致的问题，与其花费时间在”解决问题”方面，不如简单些，直接使用万能的 conda 使用纯净环境用来跑代码。
效果展示过程123conda create --name r44conda install mambamamba install r-base r-biocmanager r-dplyr r-librarian
结论引用
dugs
引言起因是看到了一个开发 macos 展示的 Web Serve, 然后发现 linux 有非常好用的相关应用，于是选择了 dugs 进行体验。
效果展示
过程1docker run -v `pwd`:/data -p 5000:5000 --rm sigoden/dufs /data -A
结论引用