2024_12_Week2

这周想看点数据库建设相关的。

12_09

https://www.x-mol.com/paper/1468698076951126016/t?adv

LCMD：肺癌代谢组数据库

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Computational and Structural Biotechnology Journal ( IF 4.4 )

Pub Date : 2021-12-07 , DOI: 10.1016/j.csbj.2021.12.002

我们构建并介绍了第一个肺癌代谢组数据库（LCMD），一个免费提供的在线数据库，存放了从 65 项基于质谱的肺癌代谢组学研究中鉴定出的 2013 年肺癌相关代谢物。研究人员可以通过两种方式探索 LCMD。首先，通过在“浏览代谢物”模式下应用各种过滤器，用户可以访问满足过滤器规格的肺癌相关代谢物列表。对于每个代谢物，用户可以获得倍数变化的值（癌症/正常）、倍数变化的统计显着性（p 值），以及所有基于质谱的肺癌代谢组学研究的比较研究设计，以识别这一点代谢物。其次，通过在“浏览研究”模式下应用各种过滤器，用户可以获得满足过滤器规格的基于质谱的肺癌代谢组学研究列表。对于每项研究，用户可以查看研究标本的类型、质谱 (MS) 方法、MS 数据处理软件和差异分析方法，以及所有已鉴定的肺癌相关代谢物。此外，每项研究的概述都通过图形摘要清楚地说明。LCMD (http://cosbi7.ee.ncku.edu.tw/LCMD/) 是第一个汇集肺癌相关代谢物有意义信息的数据库。

有趣的点：

  1. Classify the studies by year / biospecimens used / chromatography used / country
  2. 在图片上可进行放大，选择，拖动，鼠标放上去可以显示数量，可以下载。
  3. 标志物详情页